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药物化学（Medicinal Chemistry）：是建立在化学和生物学基础上，利用化学的概念和方法发现确证和开发药物，从分子水平上研究药物在体内的作用方式和作用机理的一门学科。研究任务包括：研究药物的化学结构和活性之间的构效关系；阐明药物与受体的相互作用；鉴定药物在体内吸收、转运、分布的情况及代谢产物；通过药物分子设计或对先导化合物的化学修饰获得新化学实体创制新药。研究内容涉及发现、修饰、合成和优化先导化合物，从分子水平上揭示药物及具有生理活性物质的作用机理和在体内的代谢过程。药物化学学科主要课程设置：药物化学、天然药物化学、现代分离技术及应用、药物合成和药物计算机辅助设计。

主要研究：1.先导化合物的构效关系。通过靶向筛选发现与优化作用于靶标的特异性化合物; 2.新型药物分子设计与合成。 3.改进高选择性、高效经济、环境友好的合成方法。

特色与优势：基于药理学确证的疾病药物靶标开展活性分子的设计、合成和创新方法学研究为中心的新药研发是本方向的特色，近期对300余个靶向明确的海洋生物活性小分子进行结构改造，获得30余个具有知识产权的活性化合物。近5年承担课题29项，发表学术论文38篇。