历史系现有专任教师61名，其中教授20名、副教授25名、助理教授16名，且80%具有海外学术背景。教授、副教授全员为本科生开设课程，活跃在教学第一线。现有“中国通史”国家级教学团队，建设了“民间历史文献学导论”等多门国家级和省级一流课程。历史系聘任哈佛大学、香港中文大学等海外高校教授兼任讲座教授，具有较高的国际化教学水平。

历史系为强基班学生设立生活导师（辅导员）、学业导师（班主任）和科研导师。每届强基班配置中国史、世界史一级学科的两位优秀教师担任班主任，引导学生设计学业规划。每位学生都配备一位专任老师担任科研导师，因材施教，凸显个性化培养。激励优秀青年教师开设高水平的研讨式课程，瞄准学术前沿，激发学生的学术志向。

成立“强基计划”教学指导委员会。该委员会由历史系主任担任召集人，审定通过“历史学基础学科强基暨拔尖学生培养细则”，负责定期跟踪课程进展、创新人才培养模式。

建设“强基计划”学生学习委员会。该委员会由每届强基班委组成，在强基班主任和辅导员的组织协调下开展工作，发挥学生自主学习的主观能动性，负责与学校、院系、教师沟通强基班学业与社会实践等问题。

历史系设“强基计划”专项资金，用以聘请专家讲座、开展学业竞赛、实施科研训练、奖励教学改革等。保障教学实践经费投入，保证实习基地的标准化建设与田野实践的规范化实施。

分阶学习，实施“本研一体化”培养。低年级注重学习历史学的核心知识和基础理论，高年级强化史学写作训练和批判性思维，在此基础上，贯通相关方向的硕士课程，实施“本研一体化”的培养计划，强基班学生在三年级课程结束后，可申请转入研究生阶段学习。

发展个性，强化多学科交叉训练。利用厦门大学学科齐备的综合优势，与其他学科“强基计划”合作交叉课程及学生项目。推进国内历史学“强基计划”的横向联合，互换学生访学，互认课程学分。

小班教学，打造科研创新环境。从经典阅读、外语训练、史学写作等环节推进小班教学和研讨，鼓励学生加入历史系教师的科研项目，提升本科生的科研创新能力。引导强基班学生申请大学生创新项目和科研奖励，举办本科学生论坛、工作坊，创办学术刊物进行校际交流。

历史系现拥有历史研究所、中国社会经济史研究中心、美国史研究所、中国海关史研究中心、民间历史文献研究中心、海洋文明与战略发展研究中心、考古人类学实验教学中心、闽商研究中心等高水平的教学科研平台。校外与地方政府、高层次文博单位合作，在福建、江西、浙江等省设有十余个田野实践基地。2022年，由厦门大学历史系牵头、联合中山大学、云南大学、西南大学、江西师范大学、青岛大学等高校组成的“历史学实践教学虚拟教研室”入选教育部首批虚拟教研室建设试点名单。

历史系强化学生英语交流与写作能力，聘请国外知名学者进行短期的英语授课。激励学生参加国际英语等级考试，鼓励学生学习第二外语。与澳门大学等达成合作协议，交换学生赴境外开展一学期或一年的专业学习。

与哈佛大学费正清中国研究中心合作成立历史文书工作室；在马来西亚建设“海上丝绸之路文化调研校外实践教育基地”，与新加坡国立大学合作开展研习营活动，已多渠道搭建了多样态的国际交流平台。